Tổng cục Thuế lưu ý, trường hợp doanh nghiệp sử dụng hóa đơn đầu vào là hóa đơn không hợp pháp để kê khai, nộp thuế thì bị xem xét xử phạt về hành vi trốn thuế hoặc hành vi sử dụng hóa đơn không hợp pháp theo các quy định tại Nghị định số 109/2013/NĐ-CP , Nghị định số 129/2013/NĐ-CP hoặc Nghị định số 125/2020/NĐ-CP tùy thuộc vào thời điểm kê khai hóa đơn.

Các hóa đơn không hợp pháp này đương nhiên không được kê khai khấu trừ thuế GTGT, không được hạch toán chi phí và không được dùng để đăng ký quyền sở hữu, sử dụng tài sản.