Theo đó, Thông tư đã gỡ bỏ yêu cầu phải xin xác nhận của Bộ Y tế đối với các thiết bị, dụng cụ y tế chưa định danh cụ thể.

Ngoài các thiết bị, dụng cụ y tế đã được định danh rõ, những thiết bị, dụng cụ y tế khác cũng được hưởng thuế GTGT 5% nếu: có Giấy phép nhập khẩu/ Giấy chứng nhận đăng ký lưu hành/ Phiếu tiếp nhận hồ sơ công bố tiêu chuẩn hoặc thuộc Danh mục trang thiết bị y tế được chuẩn hóa mã HS ban hành tại Thông tư số 14/2018/TT-BYT .

Các vật tư hóa chất xét nghiệm, diệt khuẩn dùng trong y tế cũng được hưởng thuế GTGT 5% mà không yêu cầu xin xác nhận của Bộ Y tế.

Thông tư có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1/8/2021.

Theo đó, các trang thiết bị y tế sau đây cũng được hưởng thuế GTGT 5% (thay vì theo quy định cũ chỉ được hưởng thuế GTGT khi có xác nhận của Bộ Y tế):

(i) thiết bị y tế có giấy phép nhập khẩu/ giấy chứng nhận đăng ký lưu hành/ hoặc phiếu tiếp nhận hồ sơ công bố tiêu chuẩn theo pháp luật về y tế;

(ii) thiết bị y tế thuộc Danh mục trang thiết bị y tế ban hành tại Thông tư 14/2018/TT-BYT .

Từ 1/8/2021 trở về sau, chính sách thuế GTGT thực hiện theo quy định sửa đổi tại Điều 1 Thông tư 43/2021/TT-BTC. Theo đó, thiết bị y tế nhập khẩu sẽ được hưởng thuế GTGT 5% khi có một trong các giấy tờ sau: giấy phép nhập khẩu/giấy đăng ký lưu hành/phiếu tiếp nhận công bố tiêu chuẩn áp dụng theo quy định pháp luật về y tế hoặc thuộc Danh mục thiết bị chuyên ngành y tế ban hành tại Thông tư 14/2018/TT-BYT .

Theo đó, khi nhập khẩu các mặt hàng thuộc Danh mục thiết bị y tế ban hành tại Thông tư 14/2018/TT-BYT thì doanh nghiệp mặc nhiên được khai báo và áp dụng thuế suất GTGT 5%, không cần thêm giấy xác nhận.

Quy định này được áp dụng thống nhất ở tất cả các khâu nhập khẩu, sản xuất, gia công và kinh doanh thương mại.

Kể từ ngày 1/8/2021, theo sửa đổi tại Thông tư 43/2021/TT-BTC, thiết bị nha khoa nhập khẩu không cần có xác nhận của Bộ Y tế khi xin hưởng thuế GTGT 5%. Thay vào đó, chỉ cần xuất trình được một trong các giấy phép như giấy phép nhập khẩu, giấy phép đăng ký lưu hành, phiếu tiếp nhận công bố tiêu chuẩn áp dụng...

Tuy nhiên, kể từ 1/8/2021, điều khoản nêu trên đã được sửa đổi tại Thông tư 43/2021/TT-BTC. Theo đó, trường hợp "Máy tạo oxy" có giấy phép nhập khẩu hoặc giấy chứng nhận đăng ký lưu hành hoặc phiếu tiếp nhận công bố tiêu chuẩn theo pháp luật về y tế hoặc thuộc Danh mục thiết bị y tế ban hành tại Thông tư 14/2018/TT-BYT thì được hưởng thuế GTGT 5%, không cần thêm giấy xác nhận.

(1) Giấy phép nhập khẩu;

(2) Giấy chứng nhận đăng ký lưu hành;

(3) Phiếu tiếp nhận hồ sơ công bố tiêu chuẩn theo quy định pháp luật về y tế;

(4) Thuộc Danh mục trang thiết bị y tế ban hành kèm Thông tư số 14/2018/TT-BYT .

Trường hợp không thuộc các trường hợp nào nêu trên thì phải chịu thuế suất GTGT 10%.

Ngược lại, nếu không có xác nhận của Bộ Y tế thì phải chịu thuế suất GTGT 10%.